В программе изменить гражданство физического лица можно из справочника «Сотрудники» (раздел Зарплата и кадры – Сотрудники – поле «Гражданство») или из справочника «Физические лица» (раздел Кадры – Физические лица – раздел «Гражданство»). Подробнее см. в ответе на вопрос ИС 1С:ИТС.
