Страховые взносы, начисленные на вознаграждение по договору ГПХ, организация вправе учитывать в составе расходов по УСН в общем порядке. При этом неважно, что сумма вознаграждения по ГПД в расходы не включается.
Подробнее см. ответ на вопрос ИС 1С:ИТС.
