ВСЕГДА ЛИ НУЖНО ЗАПОЛНЯТЬ СТРОКУ 5Б СЧЕТА-ФАКТУРЫ?

Строка 5б в отгрузочном счете-фактуре заполняется всегда, если отгрузка производится в счет ранее полученного аванса (предоплаты). Подробнее см. в ответе на вопрос ИС 1С:ИТС.