КАК УЧИТЫВАТЬ ОПЛАТУ ПО НОВОЙ ПОСТАВКЕ ПРИ НАЛИЧИИ ЗАДОЛЖЕННОСТИ ЗА ПРЕДЫДУЩИЕ?

Денежные средства, поступившие на оплату новой партии товара, нельзя учитывать в счет оплаты ранее отгруженных товаров. Подробнее см. в ответе на вопрос ИС 1С:ИТС.